Wesentliche Unterschiede zu den Asocomyceten sind nicht nur die sporentragenden Organe, sondern bei der Biologie der Fruchtkörper und speziell bei der Fortpflanzung vorhanden.

Die Basidiomyceten bestehen nur aus diploiden Hyphen, die hinsichtlich Ernährung selbständig sind und sich lediglich funktionell in vegetative und basidiogene Hyphen trennen. Die Kopulation zweier haploider Hyphen erfolgt nicht im Fruchtkörper sondern im Mycel, wonach es unter Umständen Jahre dauern kann, bis es auf günstige Umweltreize hin zur Fruchtkörperbildung kommt. Das sexuell entstandene dikaryontische Mycel kann also jahrelang im Boden weiterwachsen, ohne via Fruchtkörper zur Sporenbildung zu schreiten. Ein einziges dikaryontische Mycel kann viele Fruchtkörper bilden. Analog wie bei den Ascomyceten kommt es in der Probasidie zur Karyogamie und Meiose für die Sporenbildung.